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宏基因組測序

宏基因組測序Metagenomics Sequencing是以特定生境中的整個(gè)微生物群落作為研究對象,對樣品中的微生物群體基因組進(jìn)行高通量測序,解讀微生物種群結(jié)構(gòu)、多樣性與豐度、基因功能活性、微生物與環(huán)境、微生物與宿主相互協(xié)作關(guān)系。已廣泛應(yīng)用于微生物領(lǐng)域。

技術(shù)優(yōu)勢

  · 周期短,通量高,準(zhǔn)確性高,信息全;

  · 無需分離培養(yǎng),直接提取環(huán)境樣本DNA進(jìn)行測序,擺脫了微生物分離純培養(yǎng)的限制。周期短,通量高,準(zhǔn)確性高,信息全;

  · 能夠顯著加快宏基因組學(xué)研究的進(jìn)程,并且在鑒定低豐度的微生物群落及種類,挖掘更多基因資源;

  · 可以研究環(huán)境微生物的群落結(jié)構(gòu)、物種分類、系統(tǒng)進(jìn)化、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等。

服務(wù)流程

樣本要求

樣本類型

樣本要求

保存及運(yùn)輸條件

說明內(nèi)容

 

糞便

水體

土壤

淤泥/沉積物

糞便:3-5 g;

土壤:10 g;

血液:10 mL;

淤泥/沉積物:5-10 g。

 

糞便建議6G,水體、土壤、淤泥樣本建議12G。

 
DNA

總量≥1 μg;純度OD260/280在1.8-2.0之間;濃度≥10 ng/μL。

使用1.5 mL或2 mL離心管盛放,用parafilm封口膜密封,然后將樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子。使用足量冰袋,用泡沫箱運(yùn)輸。

 

 

 

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